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由緒

紀伊国造家旧記によると、神武天皇御東征の御代に、天道根命が神寳二種を奉じて加太浦に上陸、頓宮を造営して天照大御神を祀ったことに始まるという。 　当地は海に面して漁業の盛んなところであるため、のちに航海安全と大漁を祈願する住吉神社を合祀したらしく、文保元年（一三一七年）六月二十九日付賀太庄住吉社への寄進状（向井家文書）が残されている。
　社名については、紀伊風土記によると日野左衛門藤原光福が地頭としてこの地を支配した嘉元年間（一三〇三～一三一七年）に、自分の祖先神である春日三神をあらたに祀り、総名として「春日社」と称したとあり、嘉吉２年（一四四二年）の記録に春日明神神事日記（向井家文書）がある。 　紀伊名所図絵によると、社地はもと、現在地から東の山の中腹にあったが、天正年間（一五七三～一五九二年）に羽柴秀長の家臣で和歌山城代（当時、秀長は大和郡山に居城、大和、和泉、紀伊三国を領し、紀伊国は和歌山城代が支配）、桑山重晴によって現在地に遷したと記している。なお、棟札によって慶長元年（一五九六年）に社殿の修復がなされたことも実証されている。 　
　加太神社は、明治時代まで神職はおかず、神社経営は宮座形式の当屋制によって運営されていた。そのため、神社には記録文書類は全く存在せず、他からの資料に頼らざるを得ないが、御神徳の篤い神社であることは、「紀伊国神名帳」に「正一位春日大神」と記されており、神格の高さを知ることが出来ると共に、役小角（飛鳥時代の山岳修業者で修験道の開祖者、役行者とも称す）が、友ヶ島を行場とし、当社を勧請して守護神とされた。そのため現在でも毎年４月、加太神社に聖護院門跡が大勢の山伏しと共に参拝されていることからもわかる。
　なお、加太春日神社の現在の社名は、太平洋戦争後、全国の神社が国家の保護を離れ、宗教法人による神社に切り替わったとき、用いられたものである。